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基因水平转移研究

不依赖于培养,实现基因水平转移的可视化检测

 

基因水平转移(HGT)是指微生物物种内部和物种间进行基因交换的现象,在抗生素耐药性的快速传播中起着重要作用,筛选发生水平转移的阳性受体是环境微生物研究的难点之一。

应用PRECI SCS可视化单细胞分选仪,结合荧光标签/稳定同位素标记,可实现转移了目标基因的阳性受体的快速检出。并且,可进一步实现阳性受体的精准分离以及下游的培养或测序研究,追踪耐药基因的传播过程。

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    不依赖培养
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    高效率追踪
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    可视化检测
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    单细胞精度

荧光识别结合LIFT分选,基因水平转移研究可视化研究方案

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图片来源:Xiaojun Lin et al., The ISME Journal, 2023

传统基因水平转移的验证依赖于转移后体系的培养筛选,该过程通常横跨2-3天,并且无法用于探究环境中未培养菌的基因水平转移。

建立由携带荧光蛋白与耐药基因的供体与微生物群落受体组成的体外接合系统,采用具有荧光成像模块配置的PRECI SCS可视化单细胞分选仪,识别并分离具有特定荧光信号的阳性受体(包括可培养与未培养微生物),极大缩短实验周期,为基因水平转移领域的探究提供了有力的工具。

rD2O-Raman-LIFT,缩短阳性受体筛选周期

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图片来源:Hongzhe Li et al., Analytical Chemistry, 2020

利用反向D2O-单细胞拉曼检测技术(Raman-rD2O),PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪能够可靠且快速地追踪耐药基因的转移和扩散。

该方法具有很高的灵敏度,能够在大量受体菌中识别出少量的抗性转化子,可用于破解影响抗性质粒转移以及持续的因素,并通过与基因型的关联研究,更好地理解耐药基因的传播风险。

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