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肠道微生物

菌落“去重”筛选+单细胞靶向分离,大幅提高微生物资源库构建效率

 

肠道微生物资源的筛选与利用,对于促进健康和治疗疾病具有重要的意义。

利用RAcolony高通量菌落智能筛选系统,基于菌落形态与拉曼图谱相似性进行优势菌株去重复筛选,以提高肠道新菌发现效率,并减少筛选周期与成本。

此外,还可以采用PRECI SCS可视化单细胞分选仪,肠道微生物进行“所见即所得”地单细胞多组学研究,进一步揭开了肠道微生物的神秘面纱。

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    高效率去重复筛选
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    高精度单细胞研究

菌落原位“去重”筛选,加速肠道微生物资源开发利用

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RAcolony高通量菌落智能筛选系统可以在培养皿原位采集菌落的微观图像及拉曼光谱数据,采用AI算法,基于菌落表型相似性进行“去重”分析,以少量菌落挑取数量获得更高物种覆盖率,大大降低了筛菌周期与下游鉴定成本,为肠道微生物资源库构建与功能菌筛选提供全新技术手段。

在体序贯标记+单细胞荧光分选,揭秘肠道微生物“暗物质”

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图片来源:Juan Gao et al., mLife, 2022

使用2种D型氨基酸荧光探针(FDAA)对小鼠肠道微生物进行在体序贯标记。应用S3000超快三维荧光成像系统对具有不同荧光信号分布的微生物进行高清显微成像,再利用PRECI SCS可视化单细胞分选仪从群体中精准分选出不同荧光分布的微生物个体,经过单细胞全基因组扩增与测序,解析微生物生长分裂表型与基因型的关联关系,实现肠道未培养微生物的“所见即可知”。

基于D2O-Raman-LIFT技术,实现肠道耐药菌研究

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图片来源:Yi Wang et al., Environmental Microbiology, 2020

应用重水(D2O)标记结合单细胞拉曼光谱技术,能够对肠道中的耐药菌进行检测。采用PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪(或Scatcher Ultra单细胞拉曼光镊分选仪)可进一步通过精准的耐药菌分选与高通量测序,实现对耐药菌基因组的深入分析,或耐药基因在肠道菌群中转移的检测与研究。

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