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耐药菌研究

D2O-Raman联用,提供免培养药敏快检研究新思路

方案概述

微生物抗生素耐药抵抗是当前全球性医学问题,传统药敏检测需经过分纯培养,耗时长。

基于拉曼光谱结合重水标记(D2O-Raman)方案,P300共聚焦拉曼光谱仪能够跨越培养阶段,在短时间内完成对细菌抗生素耐药性的检测。同时通过与PRECI SCS可视化单细胞分选仪联用(或使用PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪),可实现耐药菌的进一步的分离和更加深入的机制研究,建立耐药表型与基因型的对应关系,为耐药基因在环境中的转移提供可视化研究工具。

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    免培养
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    非侵入
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    高灵敏
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    低成本

基于D2O-Raman的免培养药敏研究

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图片来源:Shuying Yuan et al., Frontiers in Microbiology, 2022

细胞吸收稳定同位素(e.g. 氘)时,拉曼光谱中的特定峰会出现位移现象。使用重水(D2O)与抗生素共同孵育微生物样品,对于有代谢活性的微生物个体,氘会进入碳骨架,在光谱静默区出现C-D峰。

采用P300共聚焦拉曼光谱仪能够在短时间内完成对细菌耐药菌的检测。

耐药基因水平转移的可视化检测

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图片来源:Hongzhe Li et al., Analytical Chemistry, 2020

利用反向D2O-单细胞拉曼检测技术(Raman-rD2O),PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪能够可靠且快速地追踪耐药基因的转移和扩散。该方法具有很高的灵敏度,能够在大量受体菌中识别出少量的抗性转化子,可用于破解影响抗性质粒转移以及持续的因素,并通过与基因型的关联研究,更好地理解耐药基因的传播风险。

耐药菌的靶向基因组学分析

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图片来源:Yi Wang et al., Environmental Microbiology, 2020

PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪(或Scather RA单细胞拉曼光镊分选仪)通过结合D2O-Raman技术与可视化分选技术,能够将具有耐药表型的微生物从群体中靶向分离出来,获得的单细胞(或细胞群)经过全基因组扩增后,可进行高通量测序,相较于传统方法,能够更准确地建立表型与基因型的关联关系。


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